1. Breve descripción de las áreas de investigación
e interés:
Modelado computacional de la estructura
y reactividad de sistemas moleculares y determinación
de mecanismos de reacción detallados a nivel molecular
y su cinética en fase gaseosa y condensada.
Aplicaciones de métodos cuánticos
y mixtos QM/MM al estudio de la estructura electrónica
de sistemas de interés biológico en los que
el reconocimiento molecular juega un papel crucial (interacciones
reactivas y no reactivas de pequeños ligandos orgánicos
y organometálicos con ADN o proteínas; interacciones
ADN-proteína) y químico (transformaciones de
radicales libres de interés en contaminación
troposférica, desarrollo de catalizadores de Pd/Pt
para la producción de combustibles con menor impacto
ambiental a bajo costo y alto rendimiento).
Líneas de trabajo de investigación
científica activas que ha montado y dirige en este
momento en el LQTC:
1) Estudio del mecanismo de acción molecular
del Cisplatino y otros análogos de Pt(II)/Pd(II)/Ru(II)
potenciales anticancerígenos, su interacción
con el ADN y el reconocimiento de lesiones por parte de proteínas
del dominio HMG;
2) Caracterización del mecanismo molecular de reacciones
de Maillard (glicación de proteínas) y su inhibición;
propiedades de AGEs y ALEs;
3) Caracterización de lesiones de origen químico
en el ADN e interacción de interruptores moleculares
de luz de Ru(II) con ADN lesionado como herramientas de diagnóstico
sensible y selectivo para enfermedades de origen genético;
4) Transformaciones químicas y bioquímicas de
cationes radicales convencionales y distónicos derivados
de alquenales, oxoaldehídos y alcoholes.
5) Interacción de fármacos antivirales con el
sitio activo de la Sialidasa de Influenza.
Otros intereses académicos: investigación
educativa en procesos de aprendizaje colaborativo e integración
transversal de disciplinas en el curriculum científico.
Filosofía e historia de las Ciencias Químicas.
2. Formación académica:
Ph.D. Cs. Químicas – 1995
– Facoltá di Scienze Fisicomatematiche e Naturali
- Universitá degli Studi di Pisa – Italia
Tesis: “Análisis del efecto del solvente en procesos
químicos que involucran la transformación de
grupos aldehído. Extensiones del modelo PCM”.
M.Sc. Química – 1991 – Facultad
de Química – UdelaR – PEDECIBA –
Uruguay
Tesis: “Estudio teórico del efecto del agua sobre
las reacciones de condensación aldólica del
acetaldehído. Un análisis sobre la confiabilidad
del uso de métodos semiempíricos en el estudio
de sistemas con enlace de hidrógeno”.
B.Sc. Química – 1988 – Facultad
de Química – UdelaR – Uruguay.
3. Áreas de pericia
y experiencia de investigación:
Fisicoquímica Teórica y Computacional - Modelado
de sistemas moleculares con métodos cuánticos:
estructura, propiedades y reactividad – Determinación
de mecanismos de reacciones químicas y en particular
caracterización de estados de transición –
Efectos del solvente con modelos de continuo (PCM) - Modelado
semiclásico de la cinética de reacciones químicas
con la Teoría Variacional del Estado de Transición
(VTST) – Estructura y reactividad de radicales convencionales
y distónicos – Reacciones de aldehídos
y oxoaldehídos – Caracterización de estados
de transición de reacciones químicas.
4. Historial Académico:
2001-2003 Directora del Instituto de Química Biológica
de la Facultad de Ciencias.
1997- Presente Profesor Agregado de Química
Teórica y Computacional (efectivo, desde 1998 en Régimen
Full Time, clasificada en la categoría A) y responsable
del LQTC.
1997 Profesor Adjunto de Química Teórica
y Computacional, Facultad de Ciencias. Contrato interino para
actuar como responsable de la instalación y conducción
académica de la Unidad Propia de docencia e investigación
homónima.
1995-1997 Asociado Postdoctoral – Dept.
of Chemistry, Institute of Technology, University of Minnesota,
Minneapolis, USA.
1995 Profesor Adjunto de Química Teórica
y Computacional (interino, contrato CSIC de reinserción),
Facultad de Ciencias.
1991-1995 Asistente de Química Teórica
y Computacional, Instituto de Química, Facultad de
Ciencias, UdelaR, Uruguay. En régimen interino 1991-1992,
en efectividad por concurso de méritos y pruebas a
partir de 1992.
1990-1991 Asistente Académico del Decano
de Facultad de Ciencias, UdelaR, Uruguay.
1990 Asistente de la Comisión para la
creación de la Facultad de Ciencias, Consejo Directivo
Central, UdelaR, Uruguay. Ingreso por concurso de méritos
(primer lugar en el área Química).
1986-1990 Ayudante Honorario de Química
Cuántica, Facultad de Química, UdelaR, Uruguay.
Ingreso por concurso de pruebas.
5. Distinciones:
2003 - Referente académico para la elaboración
de los nuevos programas de Educación Media Superior
del Uruguay en el área Química.
1999 Premio nacional CONICYT-TWAS al joven investigador (menor
de 35 años) en el área Química.
1998, 2002, 2003 – Chair en sesiones
de congresos internacionales de la especialidad en Mexico,
Uruguay y USA.
1997-1998 Grant de la Third World Academy of
Sciences in Basic Sciences para desarrollar un trabajo de
investigación en el área de reacciones de interés
en la química de la Troposfera.
1996, 1997 Referee para las revistas Journal
of Physical Chemistry, Journal of the American Chemical Society.
1995-1996 Minnesota Supercomputer Institute
Research Scholarship – scholarship post-doctoral obtenida
por concurso internacional de méritos y programa de
trabajo para trabajar en el grupo del Prof. Donald G. Truhlar.
1991-1994 Comisión de las Comunidades
Europeas-Directorado General de Ciencia y Tecnología
– Grant obtenido en concurso nacional (Uruguay) para
desarrollar proyecto Doctoral en la Universidad de Pisa bajo
la supervisión del Prof. Jacopo Tomasi.
1991 Premio Internacional Folia Chimica Theoretica
Latina al mejor trabajo de revisión publicado en la
revista en el bienio 1989-1991 por el artículo “Aplicación
de métodos semiempíricos derivados del MNDO
a la determinación de la estructura y la reactividad
de complejos de enlace de hidrógeno.” Elena L.Coitiño,
Oscar N.Ventura Folia Chimica Theoretica Latina, 17 (1989)
191-223.
1989 Instituto de Cooperación Iberoamericano
(ICI)-Agencia española para la cooperación (AECI).
Ayuda para realizar una pasantía de dos meses para
visitar la Universidad Autónoma de Barcelona, y trabajar
en el grupo del Prof. Juan Bertrán en el modelado de
reacciones de aldehídos y la caracterización
de cationes radicales derivados de aldehídos. Obtenida
por concurso a nivel nacional en la convocatoria general del
ICI de ese año.
1988-1990 - PEDECIBA-Química –
Obtención por concurso de beca de dos años de
duración para realizar estudios de Maestría
en Química bajo la orientación del Prof. Oscar
Ventura, Univ. de la República.
1988 PEDECIBA y National Research Council of
Canada (NRC) – contrato para realizar una pasantía
en el Depto. de Química del NRC-Ottawa-Canada para
realizar estudios de FTIR en fase gaseosa y condensada de
complejos de enlace de hidrógeno.
1987 Programa IUPAC-UNESCO de Química
para América Latina- Obtención de un subsidio
para realizar una pasantía de mes y ,medio en el Depto.
de Física, FCEyN, Universidad de Buenos Aires, trabajando
en la caracterización experimental por NMR de complejos
de enlace de hidrógeno de aldehídos con agua.
6. Cursos dictados
Físicoquímica II – Módulo
de Estructura y Propiedades Moleculares. Curso de nivel inicial
especialmente creado para el 2do año de la Licenciatura
en Bioquímica, Facultad de Ciencias. Se dicta con frecuencia
anual. Responsable del diseño del curso y de su puesta
en práctica y dictado de clases teóricas y discusiones
orales desde 1998 hasta el presente.
Curso-Taller de Química Teórica
y Computacional – Módulo I (caracterización
de especies participantes en procesos reactivos y sus propiedades)
y Módulo II (determinación de la cinética
empleando la VTST). Se dicta con frecuencia anual desde 1998
como curso de profundización (ofrecido para postgrados
en el contexto del PEDECIBA) y electiva para 3er año
de la Licenciatura en Bioquímica. Responsable del diseño
y dictado del curso teórico-práctico desde 1998
al presente.
Química de la Atmósfera y Polución
– Se dicta como curso de Educación Permanente
desde 1999 (inicialmente con frecuencia bianual, presencial;
actualmente con frecuencia anual en un esquema de trabajo
a distancia). Responsable del diseño del curso y su
dictado desde 1999 al presente.
Visualización y diseño asistido por PC de la
estructura tridimensional de moléculas y macromoléculas.
– Curso de Educación Permanente, dictado con
frecuencia anual desde el año 2002. Responsable del
diseño del curso y de su coordinación general
desde 2002 al presente.
Química Analítica – Coordinación
general del curso de emergencia 1999 para 1er año de
la Licenciatura en Bioquímica de Facultad de Ciencias.
Desde el año 2000 al presente responsable del dictado
de teóricos correspondientes al tema Métodos
Espectrométricos de Análisis.
Termodinámica Estadística y Cinética
– Curso de profundización dictado en el contexto
del PEDECIBA-Química en los años 1995, 1997,
1998.
Modelos Teórico-Computacionales en Fisicoquímica
– Curso dictado con frecuencia anual desde 1997 hasta
2001 como optativa para las Licenciaturas en Bioquímica
y Física. Responsable del diseño del curso y
su dictado en el quinquenio 1997-2002.
7. Publicaciones: (5 seleccionadas como las más relevantes)
How should we calculate Transition
State Geometries for Radical Reactions? The Effect of Spin
Contamination on the Prediction of Geometries for Open-Shell
Saddle Points.
Y.Y.Chuang, E. L. Coitiño, D. G. Truhlar J.Phys.Chem.A,
. 184 (2000) 446.
Interpolated Variational Transition-State
Theory by Mapping J.C. Corchado, E. L. Coitiño, Y.-Y.
Chuang, P. Fast, and D. G. Truhlar Journal of Physical Chemistry
A., 102 (1998) 2424.
Correlated Capped Subsystem
Calculations as a Way to Include Electron Correlation Locally:
A Test for Substituent Effects on Bond Energies. E.L.Coitiño,
D.G.Truhlar, K.Morokuma, Chemical Physics Letters, 259 (1996)
159.
On the Evaluation of the solvent
Polarization Apparent Charges in the Polarizable Continuum
Model: A new formulation. E.L.Coitiño, J.Tomasi, R.Cammi
Journal of Computational Chemistry, 16 (1995) 20.
Ab Initio Study of Structure
and Reactivity of H2CO.H2O+. and related radical cations,
E.L.Coitiño, R.Serrá, A.Lledós, J.Bertrán,
O.N.Ventura. Journal of the American Chemical Society, 115
(1993) 9121.
8. Otros datos académicos
8.a Orientación de trabajos de Tesis
de grado y posgrado
2003- – Tesina de graduación
de Licenciatura en Bioquímica de la Bach. Vanessa Leone
Tema: “Compuestos inhibidores del envejecimiento natural
y patológico asociados a la glucosilación no
enzimática: mecanismo de acción molecular”.
Estado: fase inicial del TE I.
2001-2003 – Tesis de Maestría en Química
del Lic. en Bioquímica Pablo Dans
Tema “Modelado de las características estructurales
y mecanismo de acción molecular de compuestos de Pd(II)
y Pt(II) con potencial acción antineoplásica”
Estado: tramo final del trabajo de investigación.
2000-2002 – Tesina de graduación
de Licenciatura en Bioquímica de la Bach. Alexandra
Castro
Tema “Análisis de la reactividad intrínseca
de nucleobases en secuencias de ADN relevantes frente a la
acción de fármacos anticancerígenos (Cisplatino
y Mitomicina C)”. Estado: concluidos TEI 11/12 y TE
II con 11/12.
2000-2002 – Tesina de graduación
de Licenciatura en Bioquímica de la Bach. Sylvia Vázquez
Tema “Cationes radicales distónicos relevantes
para la acción de sistemas enzima/coenzima B12”.
Estado: concluido TE I con 8/12.
1999-2001 – Tesina de graduación
de Licenciatura en Bioquímica del Bach. Pablo Dans.
Tema: “Modelado de la unión covalente entre fármacos
para el tratamiento del cáncer de la familia del Cisplatino
y el ADN: análisis de la viabilidad molecular de compuestos
alternativos de Pd(II)”. Estado: concluidos TEI y II
con 12/12 y 11/12.
8.b Colaboración en el desarrollo de códigos
de Química Computacional
Programa MGPISA94. Incorporación de nuevas extensiones
del modelo PCM del Solvente en el programa de Cálculo
MONSTERGAUSS87. E.L. Coitiño, R. Bonaccorsi, R. CammiUniversità
di Pisa, Pisa, Italia. 1994.
POLYRATE versions 7.0-7.1 (A
Program for Calculating Variational Transition State Theory
Chemical Rates with Semiclassical Tunneling). R.Steckler,
Y.-Y.Chuang, E.L.Coitiño, W.-P.Hu, Y.-P.Liu, G.Lynch,
K.A.Nguyen, C.F.Jackels, M.Z.Ghu, I.Rossi, P.Fast, S.Clayton,
V.M.Melissas, B.C.Garrett, A.D.Isaacson and D.G.Truhlar. University
of Minnesota, Department of Chemistry, Minneapolis, USA. 1996
and 1997.
Distribution Web Site: http://comp.chem.umn.edu/WWW/POLYRATE/POLYRATE.html
POLYRATE versions 7.2-7.3 (A Program for Calculating
Variational Transition State Theory Chemical Rates with Semiclassical
Tunneling). R.Steckler, Y.-Y.Chuang, P.Fast, E.L.Coitiño,
J.C. Corchado, W.-P.Hu, Y.-P.Liu, G.Lynch, K.A.Nguyen, C.F.Jackels,
M.Z.Ghu, I.Rossi, P.Fast, S.Clayton, V.M.Melissas, B.C.Garrett,
A.D.Isaacson and D.G.Truhlar. University of Minnesota, Department
of Chemistry, Minneapolis, USA. 1997. Distribution Web Site:
http://comp.chem.umn.edu/WWW/TRUHLAR/POLYRATE/POLYRATE.html
GAUSSRATE versions 7.2-7.3 (An interface for
running Direct Dynamics Calculations Using Modular versions
of POLYRATE and GAUSSIAN94 Codes) J. C. Corchado, E. L. Coitiño,
Y.-Y. Chuang, D. G. Truhlar University of Minnesota, Department
of Chemistry, Minneapolis, USA. 1997. Distribution Web Site:
http://comp.chem.umn.edu/WWW/GAUSSRATE/GAUSSRATE.html
DIRDYGAUSS version 7.3 (A set of utilities
for running Direct Dynamics using files fu29 or fu40 of POLYRATE
and electronic Structure Data from GAUSSIAN) M. Noland, E.
L. Coitiño, D. G. Truhlar University of Minnesota,
Department of Chemistry, USA
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